لدر DNA 100 bp

لدر DNA 100 bp پارس توس

معرفی محصول:

در دنیای پیچیده بیوتکنولوژی و ژنتیک، دقت حرف اول را می‌زند. تعیین اندازه دقیق قطعات DNA یکی از اساسی‌ترین مراحل در بسیاری از تحقیقات و کاربردهای آزمایشگاهی است.

اینجاست که DNA Marker به عنوان یک ابزار حیاتی، نقش خود را ایفا می‌کند. در میان انواع مختلف نشانگرهای DNA، لدر DNA 100 bp پارس توس با طراحی منحصر به فرد خود، به عنوان یک استاندارد قابل اعتماد و با کیفیت بالا، جایگاه ویژه‌ای پیدا کرده است.

این محصول، که توسط پارس توس، یکی از پیشروترین نام‌ها در زمینه تولید محصولات بیوتکنولوژی عرضه می‌شود، اطمینان از صحت و دقت نتایج آزمایشات شما را فراهم می‌آورد.

DNA Marker چیست و چرا اهمیت دارد؟

یک DNA Marker (نشانگر DNA) مجموعه‌ای از قطعات DNA با اندازه‌های مشخص و از پیش تعیین شده است که در الکتروفورز ژل (معمولاً ژل آگارز یا پلی‌اکریل‌آمید) همزمان با نمونه‌های DNA ناشناخته بارگذاری می‌شود.

هدف اصلی استفاده از DNA Marker، کالیبراسیون و تعیین اندازه دقیق قطعات DNA موجود در نمونه‌های آزمایشگاهی است. این قطعات DNA می‌توانند شامل محصولات PCR، قطعات حاصل از هضم آنزیمی، یا قطعات DNA کلون شده باشند. بدون یک DNA Marker دقیق، اندازه‌گیری صحیح قطعات DNA و تفسیر نتایج آزمایشگاهی عملاً غیرممکن خواهد بود.

اجزای اصلی یک DNA Marker:

• قطعات DNA با اندازه‌های مشخص: این قطعات معمولاً از منابع مختلفی مانند پلاسمیدهای از پیش برش خورده، محصولات PCR از توالی‌های شناخته شده، یا قطعات DNA سنتتیک تهیه می‌شوند.
• بافر لودینگ: این مخلوط حاوی موادی است که به DNA کمک می‌کند تا به خوبی در چاهک‌های ژل قرار گیرد و همچنین رنگ‌های ردیاب برای پیگیری فرآیند الکتروفورز را فراهم می‌کند.
• عوامل پایدار کننده: برای حفظ پایداری DNA در طول زمان نگهداری.

اهمیت DNA Marker در تحقیقات:

• تعیین اندازه: اصلی‌ترین کاربرد، مقایسه اندازه قطعات DNA ناشناخته با باندهای مرجع DNA Marker برای تخمین طول آنها است.
• تأیید نتایج: اطمینان از اینکه واکنش‌های مولکولی (مانند PCR یا هضم آنزیمی) طبق انتظار عمل کرده‌اند.
• تشخیص آلودگی: باندهای غیرمنتظره در ژل می‌توانند نشان‌دهنده آلودگی در نمونه یا مواد اولیه باشند.
• بهینه‌سازی پروتکل‌ها: در توسعه روش‌های جدید، DNA Marker به ارزیابی کارایی مراحل مختلف کمک می‌کند.

ویژگی‌های برجسته لدر DNA 100 bp پارس توس:

لدر DNA 100 bp پارس توس مخلوطی از قطعات DNA دو رشته‌ای است که به طور خاص برای پاسخگویی به نیازهای محققین و متخصصین طراحی شده است. این مارکر برای تعیین اندازه دقیق محصولات PCR و قطعات DNA مهندسی شده مورد استفاده قرار می‌گیرد.

این لدر DNA از 11 قطعه DNA با اندازه‌های مختلف رفرنس (استاندارد) تشکیل شده است که از 100bp تا 1000bp را پوشش می‌دهد. علاوه بر این، یک باند 1500bp نیز در این مجموعه وجود دارد که دامنه کاربرد آن را گسترش می‌دهد. این دامنه وسیع از اندازه‌ها، امکان تعیین دقیق طیف گسترده‌ای از قطعات DNA را فراهم می‌آورد.

جزئیات ترکیب قطعات:

این لدر DNA شامل قطعات با اندازه‌های زیر است (که اغلب با فواصل مشخصی قرار دارند):

• 100 bp
• 200 bp
• 300 bp
• 400 bp
• 500 bp
• 600 bp
• 700 bp
• 800 bp
• 900 bp
• 1000 bp
• 1500 bp

این طیف وسیع از اندازه‌ها، آن را برای طیف وسیعی از کاربردهای PCR، به ویژه آنهایی که قطعات DNA در بازه 100 تا 1000 جفت باز قرار دارند، ایده‌آل می‌سازد. باند 1500bp به عنوان یک نقطه مرجع بالا، دامنه دینامیکی تشخیص را افزایش می‌دهد.

یکی از نکات برجسته در طراحی لدر DNA 100 bp پارس توس، شدت روشنایی باندهای خاص آن است. باندهای 500bp و 1000bp در این مارکر، دو تا سه برابر روشن‌تر از باندهای دیگر هستند.

این ویژگی، تشخیص و شناسایی این باندهای رفرنس را در ژل آگارز بسیار آسان‌تر می‌کند و به محققین کمک می‌کند تا به سرعت و با اطمینان، اندازه‌گیری‌های خود را انجام دهند. این “باندهای راهنما” (landmark bands) به عنوان نقاط مرجع بصری عمل می‌کنند و دقت در تفسیر نتایج الکتروفورز را به طرز چشمگیری افزایش می‌دهند.

چرا باندهای راهنما مهم هستند؟

• تشخیص آسان: باندهای روشن‌تر به کاربر اجازه می‌دهند تا به سرعت موقعیت مرجع را در ژل پیدا کند.
• افزایش دقت: با داشتن نقاط مرجع قوی، تخمین اندازه قطعات DNA ناشناخته با دقت بالاتری انجام می‌شود.
• کاهش خطا: در مواردی که شدت اتصال رنگ به DNA متفاوت است، باندهای راهنما به نرمال‌سازی بصری کمک می‌کنند.

کاربردهای گسترده لدر DNA 100 bp پارس توس:

لدر DNA 100 bp پارس توس ابزاری چندمنظوره است که در طیف وسیعی از کاربردهای مولکولی مورد استفاده قرار می‌گیرد. برخی از مهمترین کاربردهای آن عبارتند از:

• تعیین اندازه محصولات PCR: پس از انجام واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR)، برای اطمینان از تکثیر قطعه DNA هدف با اندازه صحیح، لازم است محصولات PCR روی ژل الکتروفورز شوند و اندازه آنها با استفاده از یک DNA Marker دقیق، تعیین گردد.
• لدر DNA 100 bp پارس توس به دلیل دامنه اندازه‌ای مناسب، گزینه ایده‌آلی برای این منظور است. این شامل PCR های تشخیصی، PCR های مبتنی بر ژنوم، و PCR های برای شناسایی سویه‌های میکروبی می‌شود.
• آنالیز قطعات حاصل از هضم آنزیمی: در مهندسی ژنتیک و کلونینگ، اغلب از آنزیم‌های برش‌دهنده (Restriction Enzymes) برای برش دادن DNA در نقاط خاص استفاده می‌شود. برای تأیید برش صحیح و تعیین اندازه قطعات حاصل، استفاده از یک DNA Marker ضروری است. این برای ساخت و سازهای پلاسمیدی، تحلیل ریزبافت (RFLP) و نقشه‌برداری آنزیمی کاربرد دارد.
• تأیید اندازه و یکپارچگی پلاسمیدها و DNA ژنومی: در برخی موارد، برای بررسی اندازه و کیفیت DNA پلاسمیدی یا DNA ژنومی استخراج شده، از الکتروفورز ژل و DNA Marker استفاده می‌شود. این به خصوص در مراحل اولیه استخراج DNA برای اطمینان از سلامت مولکول DNA قبل از استفاده در مراحل بعدی مهم است.
• تشخیص آلودگی DNA در نمونه‌ها: وجود باندهای غیرمنتظره در کنار باندهای اصلی نمونه و مقایسه آنها با DNA Marker می‌تواند نشانه‌ای از آلودگی DNA باشد. به عنوان مثال، مشاهده DNA حلقوی یا DNA خطی با اندازه‌های بسیار کوچک یا بزرگ که در نمونه مورد انتظار نیستند، می‌تواند نشانه آلودگی با DNA باکتریایی، ویروسی یا DNA آزاد باشد.
• کاربرد در الکتروفورز ژل DNA: این لدر برای طیف گسترده‌ای از غلظت‌های آگارز (مثلاً 1% تا 2%) مناسب است و وضوح خوبی در باندهای DNA ارائه می‌دهد.

سهولت استفاده و سازگاری:

لدر DNA 100 bp پارس توس در اشکال آماده مصرف یا غلیظ شده عرضه می‌گردد، که این موضوع انعطاف‌پذیری لازم را برای کاربران فراهم می‌آورد. فرم آماده مصرف، نیاز به رقیق‌سازی یا اضافه کردن بافر لودینگ را از بین می‌برد و زمان آماده‌سازی آزمایش را به حداقل می‌رساند.

این نشانگر را می‌توان به راحتی با رنگ‌های متداول اسید نوکلئیک مانند اتیدیوم بروماید (EtBr) یا DNA Green Viewer رنگ‌آمیزی کرد. نکته مهم و کاربردی دیگر این است که لدر DNA 100 bp پارس توس از قبل با بافر لودینگ (Loading Buffer) مخلوط گردیده است.

این ویژگی، نه تنها باعث صرفه‌جویی در زمان می‌شود، بلکه خطر خطای انسانی در هنگام آماده‌سازی نمونه را نیز کاهش می‌دهد. بافر لودینگ حاوی گلیسرول یا ساکارز است که باعث سنگین‌تر شدن نمونه DNA می‌شود تا به خوبی در چاهک‌های ژل قرار گیرد، و همچنین شامل یک یا چند رنگ ردیاب (Tracking Dye) است که سرعت حرکت DNA در ژل را نشان می‌دهد و به کاربر کمک می‌کند تا زمان مناسب برای متوقف کردن الکتروفورز را تشخیص دهد.

مزایای استفاده از لدر از پیش مخلوط شده با بافر لودینگ:

• صرفه‌جویی در زمان: حذف مرحله مخلوط کردن بافر لودینگ، فرآیند آماده‌سازی نمونه را تسریع می‌کند.
• کاهش خطا: احتمال خطا در نسبت صحیح DNA به بافر لودینگ کاهش می‌یابد.
• یکنواختی: اطمینان از یکنواختی در آماده‌سازی نمونه‌ها، به خصوص در آزمایشگاه‌های با حجم کاری بالا.

رنگ‌های ردیاب (Tracking Dyes):

بافر لودینگ معمولاً حاوی رنگ‌هایی مانند بروموفنول آبی (Bromophenol Blue) یا زایلن سیانول (Xylene Cyanol) است. این رنگ‌ها به طور مستقل از DNA مهاجرت می‌کنند و به کاربر اجازه می‌دهند تا پیشرفت الکتروفورز را بصری پیگیری کند.

رنگ بروموفنول آبی معمولاً در ژل آگارز 1% با سرعت DNA حدود 50 جفت باز مهاجرت می‌کند، در حالی که زایلن سیانول در سرعت DNA حدود 300-400 جفت باز مهاجرت می‌کند. این رنگ‌ها به طور مستقیم به تعیین اندازه DNA کمکی نمی‌کنند، بلکه ابزار بصری برای نظارت بر فرآیند هستند.

ملاحظات مهم:

لازم به ذکر است که این مارکر مختص استفاده در آنالیزهای کمی (quantitative analysis) نمی‌باشد. به عبارت دیگر، از آن نباید برای تخمین دقیق میزان (غلظت) DNA در نمونه‌ها استفاده کرد، بلکه کاربرد اصلی آن تعیین اندازه (طول) قطعات DNA است. برای آنالیزهای کمی، روش‌ها و ابزارهای تخصصی دیگری مانند اسپکتروفتومتری یا روش‌های بر پایه فلورسانس (مانند دستگاه‌های Real-time PCR) مورد نیاز است.

چرا لدر DNA 100 bp پارس توس برای آنالیز کمی مناسب نیست؟

• تفاوت در شدت باندها: شدت باندهای DNA Marker یکنواخت نیست (مثلاً باندهای 500bp و 1000bp روشن‌تر هستند). این تفاوت‌ها، تخمین دقیق غلظت را غیرممکن می‌سازد.
• طراحی برای تعیین اندازه: این مارکرها برای ایجاد نقاط مرجع مشخص در طیف وسیعی از اندازه‌ها طراحی شده‌اند، نه برای ارائه یک استاندارد غلظت خطی.
• تغییرات در واکنش DNA با رنگ: اتصال رنگ‌های فلورسنت به DNA (مانند اتیدیوم بروماید) ممکن است بسته به اندازه و ساختار DNA متفاوت باشد، که بر شدت فلورسانس تأثیر می‌گذارد.

برای تعیین دقیق غلظت DNA، معمولاً از مواد مرجع DNA با غلظت مشخص و شناخته شده استفاده می‌شود که همراه با پروتکل‌های سنجش غلظت ارائه می‌گردند.

فایل های مرتبط با DNA Marker: